จากที่ Mark Zuckerberg ซีอีโอ Facebook ได้ให้สัมภาษณ์สื่อหลายแห่ง ก็มีประเด็นน่าสนใจจากการให้สัมภาษณ์กับ Vox โดยเขายอมรับว่า Facebook Messenger มีการตรวจสอบข้อความในการสนทนาจริง
แต่ก่อนจะตกใจกันไป Zuckerberg บอกว่าการตรวจสอบข้อความนั้นทำเพื่อป้องกันไม่ให้มีข้อความที่ไม่เหมาะสมและเพื่อความปลอดภัย โดยเฉพาะเนื้อหาที่ผิดกฎการใช้งานของ Facebook ตัวอย่างเช่น ภาพอนาจารเด็ก หรือลิงก์ที่มีไวรัส และการตรวจสอบข้อความนั้นไม่ได้ทำเพื่อการโฆษณาแต่อย่างใด
เรื่องนี้อาจทำให้ผู้ใช้งานสับสนหน่อย เพราะ Messenger เป็นการสนทนาข้อความส่วนตัว แต่สุดท้าย Facebook ยืนยันว่ากระบวนการตรวจสอบทำด้วยระบบอัตโนมัติ และอยู่บนแนวทางเหมือนกับบริษัทอินเทอร์เน็ตอื่นๆ
ทั้งนี้ Facebook Messenger มีฟีเจอร์การส่งข้อความแบบเข้ารหัส end-to-end อยู่ เพียงแต่ต้องกำหนดค่านี้เพิ่มเติมด้วย