หลังจากเปิดตัวระบบล็อกอินสองชั้น Two-Step Verification ไปเมื่อกลางปี แต่ตอนนั้นคนที่จะใช้ได้มีเพียงลูกค้าที่เสียเงินเท่านั้นหรือกลุ่ม Evernote Premium และ Evernote Business ล่าสุดได้เปิดให้ลูกค้าที่ใช้บริการฟรี ใช้งานระบบล็อกอินสองชั้นได้เช่นกัน
ขั้นตอนคือต้องเข้าไปเปิดใช้บริการระบบล็อกอินสองชั้นจากหน้าเว็บไซต์ จากนั้นลูกค้าแบบฟรีจะต้องติดตั้งแอพความปลอดภัยก่อนซึ่งรองรับทั้ง iOS, Android และ BlackBerry ส่วนลูกค้าแบบ Evernote Premium และ Evernote Business สามารถเลือกส่งข้อความแทนได้